Pan genome-All species
Pan-genome analysis of 81 Solanaceae species includes:
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S. verrucosum
S. brevicaule
S. paucissectum
S. chacoense
S. stenotomum
S. neorossii
S. vernei
S. boliviense
S. commersonii
S. tuberosum
S. candolleanum
S. buesii
S. lignicaule
S. sogarandinum
S. chomatophilum
S. burkartii
S. cajamarquense
S. multiinterruptum
S. piurae
S. andreanum
S. jamesii
S. pinnatisectum
S. bulbocastanum
S. morelliforme
S. palustre
S. etuberosum
S. pimpinellifolium
S. lycopersicum
S. chilense
S. habrochaites
S. pennellii
S. lycopersicoides
S. ochranthum
S. muricatum
S. septemlobum
S. lyratum
S. dulcamara
S. seaforthianum
S. scabrum
S. retroflexum
S. americanum
S. laciniatum
S. capsicoides
S. atropurpureum
S. viarum
S. mammosum
S. stramoniifolium
S. wrightii
S. melongena
S. aethiopicum
S. macrocarpon
S. torvum
S. pseudocapsicum
S. spirale
S. erianthum
P. grisea
P. pruinosa
P. angulata
P. pubescens
T. anomalum
I. cyaneum
C. chinense
C. annuum
C. baccatum
C. pubescens
L. biflora
D. stramonium
D. inoxia
N. physalodes
A. luridus
A. acutangulus
A. belladonna
L. barbarum
N. benthamiana
N. longiflora
N. attenuata
N. sylvestris
N. tabacum
N. tomentosiformis
P. inflata
P. axillaris
WGT
WGD
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Genome Number
Gene Cluster Number
1
4
4
7
11
13
14
18
18
21
22
24
25
27
27
28
28
29
30
33
37
S. pimpinellifolium
A. luridus
A. belladonna
S. laciniatum
S. commersonii
S. mammosum
S. piurae
N. benthamiana
S. multiinterruptum
S. retroflexum
T. anomalum
P. pubescens
S. jamesii
S. sogarandinum
S. lignicaule
P. angulata
S. habrochaites
S. chomatophilum
S. pinnatisectum
S. spirale
N. tabacum
S. morelliforme
P. inflata
I. cyaneum
S. boliviense
S. muricatum
N. tomentosiformis
S. vernei
L. barbarum
N. sylvestris
S. neorossii
S. candolleanum
S. cajamarquense
S. melongena
P. axillaris
S. stramoniifolium
S. aethiopicum
S. chacoense
S. andreanum
S. scabrum
S. buesii
C. annuum
N. attenuata
S. bulbocastanum
C. chinense
N. longiflora
S. brevicaule
S. tuberosum
A. acutangulus
S. burkartii
S. erianthum
S. paucissectum
S. torvum
C. pubescens
S. macrocarpon
N. physalodes
S. wrightii
S. viarum
C. baccatum
D. inoxia
S. lycopersicoides
S. ochranthum
S. palustre
L. biflora
S. dulcamara
D. stramonium
S. septemlobum
S. lyratum
S. pseudocapsicum
S. americanum
S. atropurpureum
S. capsicoides
S. lycopersicum
S. pennellii
S. seaforthianum
S. chilense
S. etuberosum
P. pruinosa
S. verrucosum
S. stenotomum
P. grisea
0
500
1000
1500
2000
2500
39
44
45
46
47
50
59
61
62
66
66
70
71
75
83
83
84
87
87
94
96
99
102
109
114
119
120
124
127
127
127
130
139
139
140
143
143
145
151
154
156
165
166
175
203
208
212
215
215
220
224
240
104
104
325
423
496
696
798
2298
Pan-Genome Size
Core Genome Size
0
10
20
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50000
60000
70000
Genome Number
Gene Cluster Number
551
423
314
257
161
139
138
97
96
73
58
57
50
50
47
43
41
41
39
38
38
37
36
36
35
35
35
34
34
33
32
30
30
30
29
29
29
28
28
4555
3000
1000
500
0
3000
1000
500
3141
881
839
534
313
295
270
259
203
190
172
165
161
153
153
151
129
127
125
112
94
90
88
80
79
78
77
76
74
71
70
69
65
61
60
58
57
57
55
Core
Soft-core
Specific
Dispensable
a
b
c
Genome Number
Gene Cluster Number
